Stojí na nároží ulic Rektorská a Na Universitním statku od roku 1950. Byla pojmenovaná podle kazatele ze 14. století Jana Milíče z Kroměříže. Modlitebna byla v provozu do začátku 80. let, kdy byla kvůli špatnému stavu budovy, malému počtu věřících a dostatečnému množství evangelických sborů v okolí uzavřena. Nyní se chystá rekonstrukce objektu a dostavba podle návrhu architekta Davida Vávry. Věřící zde počítají i se službou veřejnosti.